Từ tháng 2 đến tháng 9 năm 2012, các nhà nghiên cứu tại Đại học São Paulo ở Brazil đã khai quật hài cốt của Amélie, Pedro I, cũng như của Maria Leopoldina, người vợ đầu tiên của Pedro. Họ vô cùng ngạc nhiên khi biết thi thể của Amélie đã được ướp xác. Da, tóc và các cơ quan nội tạng được bảo quản. Các cuộc kiểm tra tại Bệnh viện das Clínicas đã tìm thấy một vết rạch trong Tĩnh mạch cảnh của hoàng hậu. Các chất thơm như long não và nhựa thơm được tiêm vào vết rạch trong quá trình ướp xác. Nhà khảo cổ học người Brazil Valdirene Ambiel, người chịu trách nhiệm nghiên cứu, cho biết: "Chắc chắn nó đã giúp vô hiệu hóa quá trình phân hủy". Cô ấy nói thêm rằng một yếu tố góp phần khác là chiếc quan tài, vì nó được hàn kín đến mức không có vi sinh vật nào trong đó. Trước khi cải táng, các nhà khoa học đã ướp lại hài cốt của bà bằng phương pháp tương tự như phương pháp đầu tiên.[26][27]